20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2486 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  100 
 
 
287 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  60.42 
 
 
298 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  57.52 
 
 
298 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.04 
 
 
299 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  48.76 
 
 
311 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  47.65 
 
 
306 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.86 
 
 
301 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.78 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  23.46 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.64 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  21.31 
 
 
265 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.18 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  20.35 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  26.17 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  23.61 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  25.24 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  25 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.22 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>