265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1710 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  37.93 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.97 
 
 
255 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.63 
 
 
244 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.17 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.47 
 
 
237 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  37.72 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.75 
 
 
248 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  30.81 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  34.09 
 
 
249 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.82 
 
 
262 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.16 
 
 
302 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.33 
 
 
262 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
246 aa  99  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.25 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  28.11 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  31.36 
 
 
291 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.52 
 
 
391 aa  92.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  29.39 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  29.39 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  29.52 
 
 
289 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  29.19 
 
 
261 aa  89  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  28.87 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  29.17 
 
 
292 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.79 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.95 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  30.36 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.05 
 
 
302 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  28.02 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.28 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  24.89 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  30.29 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.57 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  29.71 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  28.51 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  25.11 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  27.54 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.34 
 
 
315 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.71 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  28.23 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.42 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.42 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  28.5 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.42 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.82 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.33 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  27.78 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.41 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.41 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.34 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.04 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  24.76 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.12 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  28.88 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  27.27 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  29.17 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.5 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.83 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  28.34 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.34 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  28.34 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.34 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  26.94 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  24.76 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25.58 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.1 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  28.02 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.88 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  23.97 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  23.92 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  28.02 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  28.02 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  27.81 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  27.81 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  26.83 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  25.27 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  23.23 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  24.73 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  28.34 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  24.73 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>