207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0400 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  64.23 
 
 		 243 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  60.57 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  55.42 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.25 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.39 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.44 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  35.75 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.22 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  30.89 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.42 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.65 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  30.39 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.42 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  30.48 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.37 
 
 		 302 aa  92.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  29.35 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.84 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  28.99 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  28.99 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.29 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.29 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  28.17 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  27.23 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  28.41 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  27.27 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  28.41 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  28.72 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.61 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.61 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.61 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  28.57 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  26 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  28.57 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  29.71 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  29.71 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  29.71 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  29.14 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.71 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  29.14 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.57 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.57 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  29.14 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.57 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.57 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.6 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.59 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  25.85 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  24.4 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  26.63 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.57 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  26.96 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  27.07 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  24.53 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.71 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  27.31 
 
 		 293 aa  72  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  25.4 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  23.98 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  27.45 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  25.84 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  28 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.89 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  26.9 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  26.15 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  24.53 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  26.34 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  27.45 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  29 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.16 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.55 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  26.23 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.12 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.93 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.32 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1573  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.22 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000680472  hitchhiker  0.00723568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.89 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.7 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  27.93 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>