221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1325 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  66.67 
 
 
243 aa  345  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  67.56 
 
 
246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  59.67 
 
 
243 aa  318  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.7 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.21 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  36 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.98 
 
 
255 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.9 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
246 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.05 
 
 
302 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  32.12 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  30.05 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  30.05 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  29.02 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  24.59 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  27.89 
 
 
285 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.86 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.86 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.86 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.7 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.8 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.6 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  28.37 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  28.37 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  28.98 
 
 
301 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  25.89 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.57 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.73 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  26.89 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.73 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  26.72 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  31.43 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  26.57 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  27.64 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.67 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.13 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.28 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  26.27 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  27.23 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  27.23 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  28.93 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  27.36 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.47 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  25 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.12 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.72 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.85 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  25.85 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.85 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  30.68 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.68 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  31.25 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.41 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  30.68 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  30.46 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  30.98 
 
 
268 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.84 
 
 
391 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  30.05 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.65 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.42 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  26.39 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.69 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  26.53 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  27.68 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.96 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  26.63 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  25.64 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  30.11 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  26.79 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.68 
 
 
330 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  27.51 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  29.55 
 
 
338 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  29.55 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  29.61 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  27 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  27.03 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  27 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  25.64 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  27.12 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  27.51 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  25.21 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  25.21 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  25.21 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  25.21 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>