26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5214 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 320 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  61.82 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  43.85 
 
 		 265 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.92 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  37.12 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.94 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.52 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  28.35 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  34.8 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.43 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.23 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  25.1 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.19 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  25.66 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  23.37 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.94 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  25 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  26.89 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  24.16 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.71 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  24.83 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  20.83 
 
 		 255 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>