21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2881 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  63.81 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  52.54 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  51.18 
 
 		 311 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  51.65 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.31 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.43 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.71 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.36 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.55 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.1 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.62 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.4 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.53 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  26.37 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 265 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  24.12 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  25 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>