16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2704 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  55.4 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  52.54 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.96 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.99 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  45.58 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  45.65 
 
 		 306 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.45 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.11 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.66 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.21 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.17 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  26.92 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  20.47 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.14 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>