83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0985 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 311 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  31.99 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.8 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.71 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.38 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  24.42 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.09 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.51 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.02 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.71 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  26.87 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  29.77 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  29.75 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.81 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.23 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.43 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  27.13 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  27.17 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  24.78 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.15 
 
 		 237 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.23 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  23.53 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.55 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.78 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  29.03 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.81 
 
 		 244 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.53 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  25.73 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.1 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  30 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  29.17 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.63 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  25.17 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.68 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.42 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  32 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  29.17 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1849  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.61 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  31.31 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  25.49 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.29 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  24.62 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  24.36 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  23.39 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.22 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  30.34 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  33.75 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  30.91 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.79 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.22 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.99 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.73 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.22 
 
 		 265 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 1012 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>