56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09443 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  48.53 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.85 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 265 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.21 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.8 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.39 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  31.25 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.17 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.11 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.8 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  23.11 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.11 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0923  putative competence protein ComL  22.17 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  19.63 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  25.97 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  24.77 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  19.42 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  24.22 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.54 
 
 		 1000 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.97 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  24.54 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.43 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  24.28 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  24.06 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  22.67 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  24.59 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.29 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  26.13 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  24.12 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  26.63 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  20.09 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  24.86 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  24.7 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  22.46 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  22.09 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  21.94 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  23.19 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  21.94 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  23.19 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.98 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.48 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  18.82 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>