194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0923 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0923  putative competence protein ComL  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  31.94 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  32.39 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  26.92 
 
 		 289 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  28.37 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.57 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  30.05 
 
 		 288 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  28.96 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.32 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.57 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.94 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.94 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.82 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.94 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.82 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  25.12 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.42 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  25.22 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  26.36 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.88 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  27.31 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.81 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.93 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  27.31 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  25.54 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.75 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.26 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  25.35 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  24.27 
 
 		 284 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.64 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  23.36 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.36 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.44 
 
 		 276 aa  71.6  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.05 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  26.79 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.52 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  25.91 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  23.11 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  27.37 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.58 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  25.39 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  25.39 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  25.93 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  25.26 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.04 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.29 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  25.24 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.07 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  24.37 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  27.17 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  25.11 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  24.89 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.35 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  22.12 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  24.66 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.12 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0073  DNA uptake lipoprotein-like  28.5 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0663  outer membrane protein  24.74 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000502796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  23.42 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  23.5 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  26.85 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  22.57 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  28.57 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 278 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.92 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  23.44 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  25.82 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  22.79 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.35 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  24.06 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  24.62 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  23.42 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  20.89 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  26 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.37 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>