24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3017 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.85 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.31 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  38.22 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.12 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.08 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.86 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  32.46 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.19 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  27.69 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.79 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  24.89 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  24.71 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  23.04 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  23.97 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.36 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  21.05 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  21.31 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  20.47 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  28.85 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  19.51 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>