58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1307 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 299 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  61.82 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  41.31 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.52 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  38.26 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.83 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.96 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  27.48 
 
 		 270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.84 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  32.39 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.28 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  29.53 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  22.51 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  23.45 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  20.68 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.77 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.18 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.22 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  21.67 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  26.34 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.62 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.1 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.62 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  28.36 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  23.19 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  22.63 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  24.31 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  25.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  25.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  20.74 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  22.46 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  21.99 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 814 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.89 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.15 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  20.74 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  21.67 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.38 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  26.56 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  23.98 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.96 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  22.31 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  24.34 
 
 		 268 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  28 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  26.39 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>