21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0068 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  100 
 
 		 311 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  51.18 
 
 		 298 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  49.42 
 
 		 287 aa  254  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  45.22 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.36 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  45.58 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.57 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  25 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.4 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  26.82 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.64 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.52 
 
 		 268 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.89 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  27.11 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  23.92 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  22.63 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  28.65 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>