19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2094 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2094  putative lipoprotein  100 
 
 
306 aa  614  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  51.41 
 
 
298 aa  288  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2486  putative lipoprotein  49.42 
 
 
287 aa  249  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0068  putative lipoprotein  44.07 
 
 
311 aa  236  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.91 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2704  putative lipoprotein  47.6 
 
 
298 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.7 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.29 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  21.49 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  30.26 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.07 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.83 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.2 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  23.81 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  25 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.53 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.47 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>