124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1849 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1849  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1044  hypothetical protein  26.07 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.03 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  27.27 
 
 		 1005 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.82 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  29.92 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 		 261 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  28.35 
 
 		 259 aa  52.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  28.3 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  21.43 
 
 		 1006 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  29.82 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  28.23 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  32.76 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  22.95 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  22.95 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  22.95 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.62 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  21.31 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  32.43 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  29.57 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.13 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  26.19 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  31.53 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.05 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  25.18 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  25.18 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  25.18 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  24.56 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  24.56 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1517  hypothetical protein  31.36 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0196221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  26.61 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  30.68 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  25.57 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  25.42 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.93 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  30.63 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2360  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0361524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 377 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  24.79 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  29.03 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.43 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  22.31 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  25.62 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  28.42 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  25.44 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  23.2 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0678  Extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  28 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  31.91 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  31.91 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  30.93 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  37.04 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  24.79 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  31.91 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.16 
 
 		 1000 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  27.52 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.29 
 
 		 1001 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1031 aa  43.5  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  24.04 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  24.04 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  25.62 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1632  hypothetical protein  26.79 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.575838  normal  0.0510369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  21.49 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  24.77 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  29.91 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>