20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0960 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0960  conserved hypothetical lipoprotein  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.490847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1092  putative lipoprotein  62.68 
 
 		 215 aa  277  9e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1217  putative lipoprotein  62.68 
 
 		 215 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.426628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0649  putative lipoprotein  62.68 
 
 		 215 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.341597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1061  hypothetical protein  54.5 
 
 		 215 aa  238  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.472179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1590  hypothetical protein  53 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1959  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  53.92 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0550  competence lipoprotein  49.53 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0802793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0859  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.19 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0413  DNA uptake lipoprotein-like  34.5 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  23.08 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  26.49 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  22.22 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  22.07 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.73 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 301 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 325 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  21.97 
 
 		 302 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  22.58 
 
 		 301 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>