25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1061 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1061  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.472179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1590  hypothetical protein  66.35 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1959  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  68.45 
 
 		 215 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0550  competence lipoprotein  59.05 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0802793  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0960  conserved hypothetical lipoprotein  54.5 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.490847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1217  putative lipoprotein  53.05 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.426628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0649  putative lipoprotein  53.05 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.341597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1092  putative lipoprotein  53.05 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0859  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.46 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0413  DNA uptake lipoprotein-like  41 
 
 		 286 aa  148  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  24.85 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  23.75 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  22.67 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  22.78 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  24.69 
 
 		 274 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  21.97 
 
 		 337 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  23.27 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.61 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  22.75 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.99 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  23.37 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  19.02 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  18.4 
 
 		 299 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  23.56 
 
 		 287 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  23.43 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>