62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1959 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1959  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1590  hypothetical protein  81.4 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1061  hypothetical protein  68.45 
 
 		 215 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.472179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0550  competence lipoprotein  54.98 
 
 		 212 aa  247  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0802793  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0960  conserved hypothetical lipoprotein  53.92 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.490847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0649  putative lipoprotein  55.07 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.341597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1092  putative lipoprotein  55.07 
 
 		 215 aa  228  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1217  putative lipoprotein  54.59 
 
 		 215 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.426628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0859  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.13 
 
 		 215 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0413  DNA uptake lipoprotein-like  40 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.04 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  25 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.51 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  24.18 
 
 		 339 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  24.18 
 
 		 339 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.51 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.51 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.51 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  21.51 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  24.18 
 
 		 339 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.18 
 
 		 339 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.17 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  20.97 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  24.14 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.95 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.95 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.95 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  26.15 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  23.44 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  23.04 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  23.35 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  21.33 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  22.7 
 
 		 337 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.45 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  23.33 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  22.45 
 
 		 286 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  22.75 
 
 		 340 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 291 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  23.4 
 
 		 297 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.53 
 
 		 285 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  23.28 
 
 		 274 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  23.61 
 
 		 301 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  23.23 
 
 		 302 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  22.82 
 
 		 263 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  23.67 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  23.03 
 
 		 298 aa  41.6  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  23.61 
 
 		 301 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>