34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1590 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1590  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1959  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  81.4 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1061  hypothetical protein  66.35 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.472179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0550  competence lipoprotein  57.28 
 
 		 212 aa  254  9e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0802793  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0960  conserved hypothetical lipoprotein  53 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.490847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0649  putative lipoprotein  55.14 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.341597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1092  putative lipoprotein  55.14 
 
 		 215 aa  231  9e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1217  putative lipoprotein  54.67 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.426628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0859  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.19 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0413  DNA uptake lipoprotein-like  40.5 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  25.33 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  24.31 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  19.47 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.23 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  18.42 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  22.4 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  23.72 
 
 		 301 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.42 
 
 		 306 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  22.16 
 
 		 268 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>