293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2370 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  100 
 
 
341 aa  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  46.49 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  40.41 
 
 
343 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  39.94 
 
 
345 aa  272  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  39.83 
 
 
343 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  39.94 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  39.94 
 
 
343 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  39.94 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  39.94 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  40.12 
 
 
343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  39.53 
 
 
343 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  37.72 
 
 
344 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  28.12 
 
 
356 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  28.12 
 
 
356 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  25.31 
 
 
355 aa  126  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  25.52 
 
 
282 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  27.02 
 
 
296 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  24.43 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  23.48 
 
 
336 aa  85.9  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0971  type II secretion system protein  22.44 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  19.7 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  22.81 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  21.16 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  20.46 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  24.85 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  21.45 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  23.53 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3526  type II secretion system protein  22.14 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0180062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  20.4 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  21.1 
 
 
408 aa  69.3  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  20.54 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  20.32 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  20.9 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  19.61 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.7 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0859  general secretion pathway protein F  24.09 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  20.06 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  23.35 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  21.15 
 
 
422 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  20.98 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  21.33 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  19.77 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  20.79 
 
 
415 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  22.92 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  22.92 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  19.42 
 
 
405 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  19.88 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.79 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  21.78 
 
 
406 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  19.65 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  20.18 
 
 
406 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  20.18 
 
 
406 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  20.18 
 
 
406 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  19.14 
 
 
406 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  20.18 
 
 
406 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  20.83 
 
 
420 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  18.55 
 
 
406 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  21.14 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  19.23 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  20.34 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  19.14 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  24.71 
 
 
405 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  23.81 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  21.33 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  19.42 
 
 
402 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  21.03 
 
 
404 aa  60.1  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  20.42 
 
 
421 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  20.77 
 
 
423 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  23.11 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  21.47 
 
 
423 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  19.53 
 
 
406 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  21.22 
 
 
404 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  21.59 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  20.06 
 
 
402 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  18.95 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  20.29 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  20.45 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  20.42 
 
 
421 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  18.55 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  21.64 
 
 
413 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.43 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  22.73 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  18.84 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  23.45 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  20.88 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  20.6 
 
 
423 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  20.94 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  17.85 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  19.61 
 
 
408 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  20.99 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  19.17 
 
 
405 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  21.21 
 
 
422 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1234  type II secretion system protein  21.1 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  20.51 
 
 
414 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0185  type II secretion system protein  21.38 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0857052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  22.04 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  21.02 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  19.73 
 
 
406 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  17.86 
 
 
402 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>