More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1011 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  100 
 
 		 413 aa  829    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  65.22 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  62.23 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  58.21 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  56.66 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  44.42 
 
 		 414 aa  365  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  29.62 
 
 		 404 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  29.57 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  28.95 
 
 		 408 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 406 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  27.9 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  29.15 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  29.16 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  28.07 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  29.43 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  31.25 
 
 		 411 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  30.46 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  30.46 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  30.7 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  31.25 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  28.32 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  29.68 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  28.2 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  27.86 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  27.36 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  28.1 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  29.25 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 406 aa  186  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  31.21 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  27.83 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  27.37 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.62 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  30.88 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.37 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.24 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.97 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  26.12 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  25.07 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.73 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 405 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  28.93 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  28.61 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.91 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.51 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.33 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  25.66 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.51 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  26.74 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.94 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.09 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  28.45 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  27.67 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  29.12 
 
 		 407 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 463 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  28.2 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.09 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>