275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0462 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  100 
 
 		 336 aa  681    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  30.88 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  27.09 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 345 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  27.14 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  22.19 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  23.21 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  23.21 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  22.09 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  24.19 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  23.51 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  23.51 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  23.21 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  23.21 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  24.17 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  23.21 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  30.27 
 
 		 296 aa  86.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  22.13 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  24.46 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  21.96 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  21.96 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  21.65 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  23.3 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  21.45 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  20 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  23.82 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  23.78 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  20.51 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  20.51 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  18.98 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  21.31 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  20.11 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  19.58 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  18.73 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  19.38 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  19.88 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  19.6 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3008  type II secretion system protein  20.95 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  23.22 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  19.17 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  23.55 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  19.71 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  19.37 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0185  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0857052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  22 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  18.05 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  20.23 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  22.12 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  21.25 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  18.75 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  20.51 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  19.44 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  19.46 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  20.98 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  20.68 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  19.84 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  19.15 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  17.43 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  19.84 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  21.65 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  20.46 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  19.94 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  19.72 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  19.94 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  20.4 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  20.23 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  23.03 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  19.65 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  20.69 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  21.35 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.56 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  18.73 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3199  type II general secretion pathway (GSP) F protein  22.09 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  20.99 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  19.65 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  17.09 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  18.24 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  23.1 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  22.66 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1811  pilus biogenesis protein, putative  17.13 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.620697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  22.73 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  19.09 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  21.98 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  20.45 
 
 		 421 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  22.66 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  19.38 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  20.28 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  19.06 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  22.51 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  19.89 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  19.06 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  19.06 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  22.03 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  19.06 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  22.03 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  20.29 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>