More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1108 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  100 
 
 		 355 aa  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  49.72 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  49.72 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  28.31 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  28.01 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  27.58 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  27.58 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  27.58 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  27.27 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  27.27 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  24.07 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  25.76 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  25.42 
 
 		 282 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.81 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  25.46 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.01 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  20.36 
 
 		 422 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.33 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  24.25 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  20 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  21.22 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  21.94 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  23.23 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  22.37 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  21.8 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  22.37 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  22.38 
 
 		 463 aa  82.8  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  23.32 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  20.66 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  22.09 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  24.55 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  20.89 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  22.1 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  21.21 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  20.65 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  21.34 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.51 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  23.68 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  21.37 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  25.32 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  22.73 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  22.38 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  20.8 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  19.53 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1811  pilus biogenesis protein, putative  25.97 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.620697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  21.53 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  21.79 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  21.18 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  22.19 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  18.99 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  20.24 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  23.32 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  21.6 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  24.91 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  23.49 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  23.84 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  20.23 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  22.38 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  20.45 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  22.34 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  20.54 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  20.47 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  20.8 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  21.18 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  21.27 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  20.52 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  20.35 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  21.82 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  20.96 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  20.96 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  22.16 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  20.11 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  20.36 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  20.73 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  20.77 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  21.07 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  21.07 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  22.1 
 
 		 406 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  21.11 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  20 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  21.6 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.7 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  21.07 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  21.07 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  24.56 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  20.7 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  19.23 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  25 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  21.07 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1135  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.07 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  20.41 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  23.71 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>