220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0164 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  52.3 
 
 
296 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  25.85 
 
 
343 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  27.03 
 
 
356 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  27.03 
 
 
356 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  25.34 
 
 
343 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  25.34 
 
 
343 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  26.6 
 
 
347 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  25.17 
 
 
341 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  26.46 
 
 
343 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  25.77 
 
 
343 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  26.46 
 
 
343 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  26.46 
 
 
343 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  25.77 
 
 
343 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  26.44 
 
 
345 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  24.42 
 
 
342 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  25 
 
 
344 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  25.42 
 
 
355 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  25.77 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  24.04 
 
 
339 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  26.79 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  24.54 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  23.1 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  24.22 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  21.59 
 
 
406 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  25 
 
 
406 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  22.86 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  22.26 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  21.26 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  22.03 
 
 
409 aa  65.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  21.26 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  21.45 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  21.26 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  21.45 
 
 
406 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  24.24 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  21.59 
 
 
406 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  22.22 
 
 
393 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  21.89 
 
 
407 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  20.79 
 
 
406 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  22.89 
 
 
422 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  23.91 
 
 
403 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  22.04 
 
 
407 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  23.79 
 
 
398 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  23.79 
 
 
398 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  23.79 
 
 
398 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  23.79 
 
 
398 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  23.79 
 
 
398 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  19.66 
 
 
403 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  23.19 
 
 
395 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  20.79 
 
 
406 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  20.6 
 
 
406 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  25.63 
 
 
405 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  20.6 
 
 
406 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  25.63 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  19.14 
 
 
404 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  20.65 
 
 
407 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  22.3 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  23.92 
 
 
389 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  19.85 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  20.6 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  21.45 
 
 
392 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  23.49 
 
 
396 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  21.23 
 
 
404 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  23.97 
 
 
411 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  22.57 
 
 
407 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  23.31 
 
 
408 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  23.02 
 
 
402 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  21.66 
 
 
406 aa  55.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  23.33 
 
 
403 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  23.61 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  23.53 
 
 
397 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  22.14 
 
 
406 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  23 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  21.07 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  21.48 
 
 
406 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  23.73 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  26.59 
 
 
404 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  23.33 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1112  type II secretion system protein  22.79 
 
 
385 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000155741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  20.22 
 
 
403 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  19.49 
 
 
401 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  20.13 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  20.36 
 
 
402 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  24.23 
 
 
408 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  24.5 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  20.65 
 
 
410 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  22.18 
 
 
403 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  21.17 
 
 
401 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  21.84 
 
 
405 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  23.75 
 
 
402 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  22.18 
 
 
405 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  21.99 
 
 
405 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  21.45 
 
 
407 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  21.45 
 
 
407 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  21.45 
 
 
407 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  21.45 
 
 
407 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  22.34 
 
 
400 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  21.28 
 
 
400 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 
411 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3199  type II general secretion pathway (GSP) F protein  23.84 
 
 
381 aa  52.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>