More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1256 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  100 
 
 
347 aa  695    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  30.38 
 
 
336 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  24.19 
 
 
344 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  26.6 
 
 
282 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  26.69 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  23.78 
 
 
339 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  24.29 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  24.48 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  21.94 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  24.48 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  22.13 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  21.47 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  21.47 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  23.8 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  23.71 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  23.55 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  23.89 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  23.71 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  21.96 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  23.17 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  25 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  20.74 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  20.74 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  24.7 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  21.07 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  24.48 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  24.48 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  24.48 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  22.38 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  22.26 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  21.16 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  21.35 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  22.19 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  21.81 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  20.34 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0853  type II secretion system protein  22.9 
 
 
399 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000781273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0830  type II secretion system protein  22.9 
 
 
399 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  23.37 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  22.09 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  21.93 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1234  type II secretion system protein  25.51 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  22.79 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  19.88 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  20.05 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  19.76 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  23.16 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  20.77 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.51 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  22.26 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  25 
 
 
409 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  22.88 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  20.98 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  19.39 
 
 
406 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  21.26 
 
 
420 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  20.55 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  21.43 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  23.37 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  21.11 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  20.67 
 
 
408 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  24.29 
 
 
409 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  20.95 
 
 
401 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  19.38 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  20.17 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  23.16 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  22.76 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  21.79 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  20.14 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  20.68 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  22.06 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  20.12 
 
 
417 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  20.88 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  20.06 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  23.08 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  21.92 
 
 
407 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  21.07 
 
 
403 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  22.76 
 
 
409 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  22.01 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  19.4 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  22.55 
 
 
406 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  23.77 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  21.21 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  19.82 
 
 
417 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  21.88 
 
 
405 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  23.38 
 
 
403 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  26.12 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  24.06 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  20.6 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  22.32 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.18 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  21.65 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  19.76 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  20.06 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  18.87 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  21.41 
 
 
414 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  21.41 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  21.41 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  21.41 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  21.41 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  22.38 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  20.97 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>