More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1841 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  52.3 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  24.58 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  25.25 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  24.92 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  23.92 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  23.92 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  23.92 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  23.92 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  27.52 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  23.59 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  30.27 
 
 		 336 aa  99  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  25.66 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  25.87 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  25.08 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 344 aa  89  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  26.12 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  22.59 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  25.63 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  23.62 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1112  type II secretion system protein  25.08 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000155741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  22.38 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  24.6 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  23 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  23.05 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  21.58 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  23.64 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  24.54 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3199  type II general secretion pathway (GSP) F protein  22.15 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0547  type II secretion system protein  23.11 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171989  normal  0.0556866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  23.51 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  25.59 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  25.98 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  26.37 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  25.27 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  24.92 
 
 		 403 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  24.54 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  24 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  24.68 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1048  general secretion pathway protein F  23.23 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  23.74 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  22.45 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  26.45 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  25.9 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  22.46 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1089  general secretion pathway protein F  23.23 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.419193  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  21.61 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  25 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  23.4 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  22.99 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  22.99 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  20.74 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  24.58 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  22.99 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  22.99 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  22.99 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  23.94 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  23.27 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  24.18 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  20.78 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  24.58 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  24.91 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  19.26 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0201  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.201186 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4167  type II secretion system protein  21.17 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  21.71 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  21.74 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  23.74 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  20.94 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  22.1 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  20.34 
 
 		 388 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  19.57 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  21.25 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  22.48 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  22.51 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.53 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  20.66 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  24.26 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  25 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  22 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0674  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  23.93 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  22.03 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  22.38 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0577  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00962618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>