More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0201 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0201  type II secretion system protein  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.201186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0185  type II secretion system protein  73.57 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0857052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 424 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 420 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 424 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  32.62 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.94 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  32.37 
 
 		 408 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 408 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 409 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  32.01 
 
 		 419 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 405 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 405 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.27 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 405 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.74 
 
 		 404 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 406 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 405 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 406 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  29.14 
 
 		 406 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 406 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.78 
 
 		 402 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  30.47 
 
 		 407 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 406 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30.85 
 
 		 412 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  28.78 
 
 		 406 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  29.86 
 
 		 463 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 463 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  30 
 
 		 406 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 407 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 405 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0480  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 404 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 405 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  29.97 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.86 
 
 		 406 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  27.7 
 
 		 405 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  29.86 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 405 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  29.86 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  28.42 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 421 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 404 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 422 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 409 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 410 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.42 
 
 		 405 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 417 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.52 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0547  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171989  normal  0.0556866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  27.7 
 
 		 405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 417 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 419 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.03 
 
 		 423 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  29.14 
 
 		 407 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.42 
 
 		 419 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 420 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  25.27 
 
 		 416 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  28.1 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  30.21 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 405 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2819  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0428074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0095  type II secretion system protein  32.87 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0577  type II secretion system protein  32.87 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00962618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  27.74 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  27.34 
 
 		 402 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  26.52 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 409 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  27.66 
 
 		 406 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 421 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3662  type II secretion system protein F  31.65 
 
 		 403 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0992285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 421 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>