More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0185 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0185  type II secretion system protein  100 
 
 		 348 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0857052  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0201  type II secretion system protein  73.57 
 
 		 280 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.201186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  32.46 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.46 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  31.58 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 424 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.5 
 
 		 419 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  31.58 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.74 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.97 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  30.68 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 408 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 405 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 405 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.65 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.7 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 463 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  28.95 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  32.94 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.5 
 
 		 404 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0480  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  29.34 
 
 		 412 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.97 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.96 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  28.61 
 
 		 406 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  28.61 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.3 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 419 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 406 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.69 
 
 		 409 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  28.95 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  29.2 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.36 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0547  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171989  normal  0.0556866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2819  type II secretion system protein  31.56 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0428074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0095  type II secretion system protein  30.97 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0577  type II secretion system protein  30.97 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00962618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2532  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.79 
 
 		 377 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1312  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.79 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3250  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.79 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0454  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.79 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3662  type II secretion system protein F  30.68 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0992285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.61 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  28.19 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3528  type IV pilus assembly protein PilC  30.09 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  27.62 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3532  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.09 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3507  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.09 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1135  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.38 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  26.51 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 407 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.17 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>