More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0505 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  100 
 
 		 401 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0480  type II secretion system protein  99 
 
 		 404 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0547  type II secretion system protein  88.28 
 
 		 403 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171989  normal  0.0556866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0095  type II secretion system protein  89.03 
 
 		 403 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0577  type II secretion system protein  89.03 
 
 		 403 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00962618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3662  type II secretion system protein F  87.53 
 
 		 403 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0992285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2819  type II secretion system protein  84.29 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0428074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3528  type IV pilus assembly protein PilC  61.15 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3250  type IV pilus biogenesis protein PilC  60.4 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1312  type IV pilus biogenesis protein PilC  60.4 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0454  type IV pilus biogenesis protein PilC  60.4 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3532  type IV pilus biogenesis protein PilC  61.15 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3507  type IV pilus biogenesis protein PilC  61.15 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2532  type IV pilus biogenesis protein PilC  61.44 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1135  type IV pilus biogenesis protein PilC  57.71 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3453  type II secretion system protein  57.75 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0854257  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2656  type II secretion system protein  55.39 
 
 		 407 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.820857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0503  type II secretion system, subunit F / Type IV pilus assembly protein TapC/PilC  59.06 
 
 		 409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  36.16 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.29 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  36.95 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  37.84 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  37.28 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  34.59 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  34.51 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  37.06 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  37.19 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  36.2 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  34.59 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  35.28 
 
 		 405 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  36.41 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.65 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  35.28 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 421 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  35.87 
 
 		 422 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.09 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  35.86 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.65 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.21 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  36.09 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 405 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  35.15 
 
 		 419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  36.95 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  35.25 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  37.09 
 
 		 410 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.66 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  33.74 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  33.93 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  34.24 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  33.74 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  37.75 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  38.31 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  33.84 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 463 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.18 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  35.52 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  34.41 
 
 		 463 aa  245  8e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  36.66 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  34.67 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  35.31 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  37.47 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  35.38 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.82 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.59 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  35.63 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  35.64 
 
 		 421 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  31.84 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  35.57 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  32.75 
 
 		 401 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  36.21 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  32.67 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.17 
 
 		 408 aa  225  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  36.34 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  33 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  36.07 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 419 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>