More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1312 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3532  type IV pilus biogenesis protein PilC  99.26 
 
 
405 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2532  type IV pilus biogenesis protein PilC  100 
 
 
377 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3250  type IV pilus biogenesis protein PilC  100 
 
 
405 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3528  type IV pilus assembly protein PilC  99.26 
 
 
405 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3507  type IV pilus biogenesis protein PilC  99.01 
 
 
405 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1312  type IV pilus biogenesis protein PilC  100 
 
 
405 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1135  type IV pilus biogenesis protein PilC  87.41 
 
 
405 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0454  type IV pilus biogenesis protein PilC  100 
 
 
405 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2656  type II secretion system protein  63.41 
 
 
407 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.820857  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0480  type II secretion system protein  60.4 
 
 
404 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  60.4 
 
 
401 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3453  type II secretion system protein  62.38 
 
 
409 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0854257  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3662  type II secretion system protein F  59.51 
 
 
403 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0992285  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0547  type II secretion system protein  60 
 
 
403 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171989  normal  0.0556866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0503  type II secretion system, subunit F / Type IV pilus assembly protein TapC/PilC  63.05 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.341066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0095  type II secretion system protein  60 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0577  type II secretion system protein  60 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00962618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2819  type II secretion system protein  58.15 
 
 
405 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0428074  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.34 
 
 
405 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  38.29 
 
 
405 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  36.84 
 
 
405 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  36.16 
 
 
408 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.59 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  35.16 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36.02 
 
 
407 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  35.86 
 
 
401 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  34.58 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  34.31 
 
 
420 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  36.17 
 
 
422 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.28 
 
 
423 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  35.61 
 
 
420 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  36.48 
 
 
408 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  37.28 
 
 
423 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  36.52 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  34.43 
 
 
407 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  35.1 
 
 
406 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  37.03 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  35.16 
 
 
405 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  34.41 
 
 
421 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  35.45 
 
 
422 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  35.7 
 
 
408 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  35.41 
 
 
424 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  36.34 
 
 
419 aa  255  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.17 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.17 
 
 
405 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33.33 
 
 
421 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.94 
 
 
403 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  34.48 
 
 
422 aa  252  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  36.87 
 
 
421 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  33.67 
 
 
405 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  35.01 
 
 
409 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  34.68 
 
 
405 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.17 
 
 
419 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  37.28 
 
 
423 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  37.16 
 
 
405 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  34.32 
 
 
405 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  33.25 
 
 
405 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  33.83 
 
 
407 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.43 
 
 
404 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  34.18 
 
 
417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  38.27 
 
 
410 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  33.98 
 
 
407 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.11 
 
 
404 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  36.22 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  34.78 
 
 
412 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  36.78 
 
 
423 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.73 
 
 
419 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  32.84 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  33.33 
 
 
405 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  38.19 
 
 
422 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  36.78 
 
 
423 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  32.34 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  36.36 
 
 
421 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  33.33 
 
 
410 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.08 
 
 
405 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.02 
 
 
406 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  36.87 
 
 
421 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  35.09 
 
 
421 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  33.67 
 
 
406 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  33.58 
 
 
405 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.85 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  36.11 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.66 
 
 
417 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.41 
 
 
417 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.59 
 
 
405 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.33 
 
 
408 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.01 
 
 
405 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.42 
 
 
401 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  31.99 
 
 
406 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  31.99 
 
 
406 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  35.95 
 
 
407 aa  226  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.41 
 
 
417 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  35.95 
 
 
407 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  31.86 
 
 
463 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  31.86 
 
 
463 aa  225  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  31.02 
 
 
407 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  30.33 
 
 
419 aa  222  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.83 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  32.84 
 
 
419 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.84 
 
 
419 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>