More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0457 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  100 
 
 		 406 aa  805    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.17 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 420 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.9 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.98 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.64 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.47 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.26 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  30.64 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.29 
 
 		 463 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.64 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  26.85 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.43 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  27.56 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.01 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  26.03 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  27.9 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  28.08 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 417 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  24.7 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  25.06 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.14 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  26.41 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.32 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  26.1 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.33 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.12 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  25 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  25 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  26.28 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  28.12 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  28.85 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  28.43 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  24.82 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  28.61 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  27.38 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  27.22 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  26.32 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  26.12 
 
 		 408 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  25.06 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.14 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  26.77 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  28.29 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0480  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  25.42 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  25 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  26.81 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  25.18 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  25.06 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  25.06 
 
 		 409 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  29.02 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  24.02 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  25.61 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  28.35 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  25.61 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  28.45 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  28.36 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3662  type II secretion system protein F  27.86 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0992285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  25.43 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  24.34 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>