More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1043 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  99.74 
 
 		 378 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  99.75 
 
 		 399 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  100 
 
 		 399 aa  810    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  56.14 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  49.25 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  50.25 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0625  type IV pilin biogenesis protein  50.13 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  44.5 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  38.44 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  38.44 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  38.44 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  38.19 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  38.19 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0650  type IV pilin biogenesis protein  41.75 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0112  type IV pilin biogenesis protein  39.2 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0263524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  39.2 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  39.2 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  39.2 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  39.2 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  39.2 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0110  type IV pilin biogenesis protein  39.2 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000393014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0109  type IV pilin biogenesis protein  39.2 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0111048  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.67 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.36 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  31.33 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  31.33 
 
 		 407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.83 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.01 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  31.59 
 
 		 422 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.77 
 
 		 419 aa  233  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.88 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  32.67 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.02 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  31 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  32.34 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.96 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.52 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 423 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.15 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.16 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 405 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30.42 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 421 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.73 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  33.5 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  32.89 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  30.22 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 409 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  29.68 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  30.08 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.97 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 406 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.52 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30.77 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  28.72 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.75 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  31.66 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  30.42 
 
 		 410 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  29.07 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>