More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3764 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  89.53 
 
 		 401 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  100 
 
 		 401 aa  811    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  55.36 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0625  type IV pilin biogenesis protein  56.39 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  50.25 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  50.51 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  51.06 
 
 		 378 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  51.25 
 
 		 399 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  39.4 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  39.4 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  39.15 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  39.15 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  38.9 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0112  type IV pilin biogenesis protein  40.05 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0263524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  40.3 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  40.3 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  40.3 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  40.3 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  40.3 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0110  type IV pilin biogenesis protein  40.3 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000393014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0109  type IV pilin biogenesis protein  39.55 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0111048  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0650  type IV pilin biogenesis protein  38.54 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.58 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.93 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.42 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.09 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.41 
 
 		 408 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.9 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  29.82 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.24 
 
 		 419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  32.18 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.97 
 
 		 421 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  32.75 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.5 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.07 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  32.59 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  31.95 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.16 
 
 		 404 aa  199  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  29.62 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.99 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.48 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  32.02 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.3 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  31.35 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.5 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  31.19 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  28.39 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  29.15 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  31.27 
 
 		 405 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  30.52 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  29.34 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  30.4 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  30.15 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>