More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0650 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0650  type IV pilin biogenesis protein  100 
 
 
398 aa  810    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  55.53 
 
 
400 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  55.78 
 
 
400 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  56.03 
 
 
400 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  55.53 
 
 
400 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  55.53 
 
 
400 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0805411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  58.54 
 
 
400 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  58.54 
 
 
400 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  58.29 
 
 
400 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0110  type IV pilin biogenesis protein  58.29 
 
 
400 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000393014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  58.54 
 
 
400 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  58.54 
 
 
400 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0109  type IV pilin biogenesis protein  58.29 
 
 
400 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0111048  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0112  type IV pilin biogenesis protein  57.54 
 
 
400 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0263524  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  41.9 
 
 
399 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  41.65 
 
 
399 aa  296  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  41.95 
 
 
378 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  41.85 
 
 
399 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  38.96 
 
 
401 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  37.5 
 
 
400 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  38.29 
 
 
401 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0625  type IV pilin biogenesis protein  38.9 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.08 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.03 
 
 
405 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.47 
 
 
403 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.27 
 
 
405 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.1 
 
 
405 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.86 
 
 
422 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.78 
 
 
421 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.07 
 
 
405 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.47 
 
 
409 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  30.22 
 
 
406 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  27.27 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  28.43 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.14 
 
 
406 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  27.78 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  28.39 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.28 
 
 
420 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.18 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  27.41 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  29.06 
 
 
409 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.25 
 
 
419 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  29.22 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.32 
 
 
404 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  29.5 
 
 
417 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  28.79 
 
 
401 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.53 
 
 
422 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  28.82 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.95 
 
 
463 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.05 
 
 
406 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.61 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  27.99 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 
412 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.95 
 
 
463 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  27.39 
 
 
417 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  27.39 
 
 
417 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  29.57 
 
 
405 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  28.36 
 
 
417 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  28.78 
 
 
423 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.24 
 
 
407 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  28.86 
 
 
410 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.59 
 
 
401 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  28.03 
 
 
421 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  31.21 
 
 
407 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  26.25 
 
 
406 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  27.02 
 
 
405 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  27.21 
 
 
411 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.2 
 
 
419 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  27.81 
 
 
407 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.32 
 
 
408 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  26.72 
 
 
419 aa  186  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  29.65 
 
 
421 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.47 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  26.52 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  27.14 
 
 
417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  27.07 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  29 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  26.14 
 
 
405 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  26.8 
 
 
403 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  25.89 
 
 
405 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  26.34 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  26.34 
 
 
424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  26.44 
 
 
416 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.97 
 
 
403 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  26.63 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  27.23 
 
 
404 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30.18 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  29.5 
 
 
407 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  27.41 
 
 
407 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  27.3 
 
 
407 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  26.73 
 
 
406 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  26.72 
 
 
419 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  25.56 
 
 
408 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  29.15 
 
 
423 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  26.01 
 
 
422 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  25.38 
 
 
405 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.33 
 
 
419 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  28.22 
 
 
409 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.14 
 
 
421 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  28.71 
 
 
423 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>