More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1749 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  100 
 
 		 397 aa  785    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1271  type II secretion system protein  54.59 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0853  type II secretion system protein  47.98 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000781273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0830  type II secretion system protein  47.98 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.89 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  34.63 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  33 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.5 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 405 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.01 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  32.6 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  31.78 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  34.58 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.84 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  31.17 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  31.9 
 
 		 407 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  30.6 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  30.08 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  30.7 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  33.25 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.42 
 
 		 424 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  30 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  31.51 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 404 aa  196  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  29.31 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  31.5 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 405 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  28.89 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  30.69 
 
 		 407 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  28.4 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.21 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.68 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.1 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 420 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.6 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.22 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  29.04 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  28.21 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 422 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.24 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  29.1 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.95 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>