More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0205 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 342 aa  681    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  46.49 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  36.15 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  35.57 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  35.28 
 
 		 343 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  35.47 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  35.47 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  35.17 
 
 		 343 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  35.17 
 
 		 343 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  34.88 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  35.38 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  23.42 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  24.42 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  23.44 
 
 		 403 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  22.29 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  20.47 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  21.36 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  21.28 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0830  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0853  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000781273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  20.94 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  21.64 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  26.45 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.29 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  20.63 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  20.4 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  20.36 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  20.34 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  20.29 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  20.29 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  21.96 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  20.29 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  20.29 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  20.29 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  20.47 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  19.94 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  22.86 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0185  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0857052  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  20.53 
 
 		 406 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  19.82 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.06 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  21.16 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  19.76 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  20.29 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  20.23 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0201  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.201186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  21.2 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  20.46 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  22.5 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  21.19 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  20.34 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  18.75 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  19.65 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  20.69 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.83 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  19.77 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.06 
 
 		 423 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  20.56 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  20.18 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  20.18 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  19.7 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  18.05 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  24.43 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  22.25 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  22.61 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  20.9 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  20.23 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  19.25 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  21.13 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  22.22 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  20.64 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  22.51 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  20.11 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.79 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0480  type II secretion system protein  24.14 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  19.6 
 
 		 419 aa  65.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  21.48 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  23.85 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  20.41 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  25.99 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0674  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  19.31 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  19.94 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  20.3 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  28.48 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  20.23 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  23.65 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  19.76 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>