More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1635 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  100 
 
 
356 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  100 
 
 
356 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  49.72 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  24.05 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  24.93 
 
 
345 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  24.93 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  24.93 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  22.22 
 
 
342 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  24.63 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  24.34 
 
 
343 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  24.33 
 
 
343 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  24.33 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  24.33 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  24.33 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  26.09 
 
 
341 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  27.03 
 
 
282 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  23.05 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  22.07 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  21.47 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  21.25 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  22.1 
 
 
405 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  22.4 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  20.98 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  22.54 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.32 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  22.83 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  21.78 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  22.86 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  22.86 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  22.86 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  22.06 
 
 
405 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  22.49 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  22.06 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.45 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  26.39 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  23.01 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  22.97 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  22.69 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  22.85 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  22.89 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.12 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  22.45 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  21.13 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  21.33 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  22.03 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  22.77 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  22.1 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  21.47 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  22.57 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  26.07 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  21.2 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  21.04 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  19.34 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  21.37 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  25.2 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  19.53 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  23.19 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  21.99 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  25.71 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  23.64 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  23.74 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  24.73 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  19.48 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  20.91 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  19.43 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.19 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  21.82 
 
 
404 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  21.66 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  23.12 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  22.12 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  19.56 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  22.86 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  21.69 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  20.91 
 
 
422 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  21.24 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  21.21 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  23.37 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  21.74 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  20.34 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  20.42 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1112  type II secretion system protein  22.16 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000155741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  19.08 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  21.41 
 
 
422 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  22.16 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  21.07 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  23.37 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  17.92 
 
 
409 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  20.41 
 
 
421 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  19.6 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  20.12 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  19.61 
 
 
400 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>