71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1274 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  100 
 
 		 339 aa  680    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  23.78 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  24.93 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  24.04 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  21.87 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  25 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  23.85 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  21.93 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  22.69 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  20.29 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  22.69 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  21.84 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  26.5 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  21.1 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  21.1 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  21.1 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  21.1 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  21.1 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  22.73 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  20.98 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  21.38 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  19.4 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  23.77 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  22.77 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  21 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  20.66 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  20.81 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  20.33 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  22.08 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  19.46 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  19.13 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  22.7 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.13 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  18.79 
 
 		 406 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  20.67 
 
 		 406 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  18.79 
 
 		 406 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  18.79 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  21.51 
 
 		 407 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  20.83 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  19.8 
 
 		 406 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  22 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  21.23 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  18.31 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  23.49 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  21.75 
 
 		 403 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  18.87 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  18.67 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  19.33 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  18.46 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  18.46 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  18.58 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  19.54 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  18.71 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  21.28 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  20.65 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  20.9 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  23.29 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  19.67 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  21.92 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  19.28 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  18.12 
 
 		 406 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  20.79 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3028  type II secretion system protein  21.32 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000329873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  20.79 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  18.87 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>