236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0554 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0554  type II secretion system protein  100 
 
 		 344 aa  702    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1256  Type II secretory pathway/competence component  24.85 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0462  Type II secretory pathway/competence component  27.06 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1274  Type II secretory pathway/competence component  26.47 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0164  competence protein CglB  25.77 
 
 		 282 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2370  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  21.78 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  23.03 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  23.03 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  21.26 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  21.56 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1635  type II secretion system protein  22.13 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.112726  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1601  type II secretion system protein  22.13 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4144  comG operon protein 2  21.82 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  21.82 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4465  ComG operon protein 2  21.82 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4263  comG operon protein 2  21.82 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3984  comG operon protein 2  21.21 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0467439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2927  type II secretion system protein  20.93 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.66616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1841  ABC transporter  25.75 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  23.1 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1108  comG operon protein 2, putative  24.65 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  22.99 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  19.08 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  21.39 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  22.29 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  20.24 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  19.82 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  21.01 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  21.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  19.63 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  21.6 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  21.6 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  22.49 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  20.34 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  26.48 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  20.12 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  20.68 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  20.3 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  22.13 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  21.1 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  20.88 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  19.57 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  21.85 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0859  general secretion pathway protein F  24.71 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  20.49 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  19.82 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  21.85 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  19.82 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  21.3 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  19.6 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  18.95 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  18.66 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  19.82 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  19.82 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  19.82 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  22.04 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  21.15 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  19.88 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  19.53 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0740  type II secretion system protein  23.82 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  19.94 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  20.96 
 
 		 409 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  18.29 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  23.15 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  22.05 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  21.32 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  22 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  19.94 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  22.92 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.48 
 
 		 423 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  21.43 
 
 		 409 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  20.24 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  20.6 
 
 		 402 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  20.6 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  20.52 
 
 		 412 aa  52.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 415 aa  52.8  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  20.18 
 
 		 403 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.3 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  19.82 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  19.86 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  21.12 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  20.6 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  20.47 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  20 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>