More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1232 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  75.9 
 
 		 415 aa  650    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  100 
 
 		 411 aa  830    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  62.23 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  63.04 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  58.84 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  45.87 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  31.53 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  29.51 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  29.51 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  30.66 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 404 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  31.12 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  31.41 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.73 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  31.53 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.25 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  30.59 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  30.75 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  30.55 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  30.75 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  30.75 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  29.78 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.75 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.43 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  28 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  26.68 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  26.89 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  25.94 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  28.12 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  28 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  31.23 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  28 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.18 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.83 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  29.86 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  30.03 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.91 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.75 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  25.25 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  24.81 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  29.36 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  27.62 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  27.83 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.3 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.94 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.87 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  28.57 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  24.63 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  27 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  25.81 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  25.73 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  26.73 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  25.72 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  27.99 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>