More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1051 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  100 
 
 
413 aa  832    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  64.18 
 
 
415 aa  534  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  63.04 
 
 
411 aa  519  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  59.52 
 
 
413 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  58.21 
 
 
413 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  45.63 
 
 
414 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  30.66 
 
 
393 aa  226  8e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  29.9 
 
 
409 aa  226  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  30.9 
 
 
392 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  31.03 
 
 
406 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  30.66 
 
 
392 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  30.75 
 
 
406 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  30.75 
 
 
406 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  30.75 
 
 
406 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  31.5 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  31.89 
 
 
411 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  31.21 
 
 
406 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  30.92 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  30.42 
 
 
406 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  30.79 
 
 
405 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  30.35 
 
 
404 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  30.35 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  30.64 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  29.89 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  30.38 
 
 
408 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  30.95 
 
 
405 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  32.75 
 
 
407 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  27.23 
 
 
405 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  30.35 
 
 
406 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  30.36 
 
 
422 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  28.94 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.2 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  26.81 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  31.04 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  30.55 
 
 
408 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  30.23 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.94 
 
 
419 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.43 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.9 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  29.77 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.15 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  30.09 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  28.41 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  29.86 
 
 
422 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.17 
 
 
403 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  29.55 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  30.24 
 
 
419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  28.86 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  29.36 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  31.3 
 
 
420 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  27.91 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29.71 
 
 
405 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  27.76 
 
 
405 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  29.71 
 
 
406 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.76 
 
 
421 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  30.72 
 
 
406 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.65 
 
 
423 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  28.86 
 
 
417 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  29.81 
 
 
407 aa  192  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.78 
 
 
405 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.31 
 
 
419 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.65 
 
 
407 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  27.95 
 
 
408 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  28.49 
 
 
405 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  28.25 
 
 
403 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  27.91 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  29.36 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  27.39 
 
 
405 aa  189  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  26.72 
 
 
405 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  28.65 
 
 
406 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  28.49 
 
 
422 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  25.44 
 
 
405 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.51 
 
 
424 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  28.32 
 
 
423 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.51 
 
 
420 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.37 
 
 
419 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  28.24 
 
 
408 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  27.17 
 
 
409 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  28.86 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  28.86 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  26.69 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.79 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  28.97 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  26.16 
 
 
405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.23 
 
 
423 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.24 
 
 
421 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  26.47 
 
 
405 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  28.31 
 
 
405 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  29.45 
 
 
421 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.48 
 
 
405 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  26.23 
 
 
405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25.99 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  29.65 
 
 
421 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.87 
 
 
402 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 
412 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  27.43 
 
 
373 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  24.76 
 
 
406 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  28.37 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  27.07 
 
 
405 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  27.5 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>