More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0674 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0633  type IV pili biogenesis protein PilC  98.76 
 
 		 402 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0674  type II secretion system protein  100 
 
 		 402 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4537  type II secretion system protein  82.84 
 
 		 402 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  44.84 
 
 		 405 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  46.72 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  43.07 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  43.07 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  44.7 
 
 		 405 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  48.01 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  43.39 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  42.29 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  44.36 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  41.31 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  44.47 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  43.58 
 
 		 405 aa  319  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.4 
 
 		 405 aa  318  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  41.06 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  41.06 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  42.43 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  40.15 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  39.45 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  40.59 
 
 		 422 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  41.5 
 
 		 406 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  41.25 
 
 		 406 aa  309  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  41.16 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  39.3 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  41.06 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  44.42 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.1 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  40.4 
 
 		 420 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  41 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.6 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  39.39 
 
 		 422 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  38.31 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  38.29 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  37.38 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.95 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  37.38 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  39.75 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  38.48 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  40.85 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  38.12 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  38.85 
 
 		 421 aa  292  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  41.1 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  41.1 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  40.85 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  38.35 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  41.1 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  37.78 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  39.5 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  43.47 
 
 		 410 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 424 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  38.81 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  38.48 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  37.87 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  40.4 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  39.29 
 
 		 407 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  39.9 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  40.3 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  36.27 
 
 		 421 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  37.06 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  39.5 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  39.39 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  39.55 
 
 		 422 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  40 
 
 		 410 aa  279  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  36 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  34.83 
 
 		 405 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  36.27 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  38.83 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  34.66 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  41.86 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 417 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  36.71 
 
 		 405 aa  255  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.18 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  36.43 
 
 		 403 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  34.75 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  35.91 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  36.18 
 
 		 419 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  35.86 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.61 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  35.61 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.66 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  34.34 
 
 		 407 aa  232  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  35.88 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 406 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3453  type II secretion system protein  38.82 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0854257  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  30.46 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>