More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1811 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  96.76 
 
 		 339 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1811  pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 339 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.620697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  23.78 
 
 		 401 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  24.23 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  21.83 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  22.62 
 
 		 407 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  19.46 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  20.47 
 
 		 408 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  23.63 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  23.12 
 
 		 407 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  20 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  22.09 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 409 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  22.02 
 
 		 407 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  22.19 
 
 		 405 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  21.57 
 
 		 410 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 403 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  21.24 
 
 		 406 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  19.39 
 
 		 406 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  19.88 
 
 		 411 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  21.93 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  22.92 
 
 		 403 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  25.53 
 
 		 411 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 404 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  21.45 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  21.35 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  19.71 
 
 		 406 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  21.87 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  21.87 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  21.87 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  21.87 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  21.97 
 
 		 407 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  21.76 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3028  type II secretion system protein  22.86 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000329873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  19.46 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  19.46 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  20.82 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  22.46 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  21.37 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  21.1 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  19.46 
 
 		 399 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 405 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  20.66 
 
 		 405 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  20.69 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  20.82 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  21.21 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  20.47 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  20.82 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  20.53 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  19.01 
 
 		 404 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  24.72 
 
 		 400 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  21.19 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 408 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  20.53 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  20.72 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  24.43 
 
 		 400 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  19.83 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  22.54 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  22.12 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  20 
 
 		 433 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  21.34 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  19.58 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  21.08 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  20.77 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  22.26 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  22.22 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  20.47 
 
 		 405 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  22.81 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  19.48 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  19.64 
 
 		 407 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  22.09 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  19.77 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  20.57 
 
 		 406 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  21.88 
 
 		 408 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  18.82 
 
 		 463 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  22.16 
 
 		 403 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  21.45 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  22.92 
 
 		 402 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  20.54 
 
 		 407 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  18.82 
 
 		 463 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  22.52 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  21.08 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  20.12 
 
 		 407 aa  85.9  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  20.06 
 
 		 405 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  19.77 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  20.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3008  type II secretion system protein  19.16 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  21.01 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  21.11 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  20.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  20.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  20.06 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  20.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>