More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5560 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 408 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4487  putative high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.37 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  22.52 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.28 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  27.12 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  23.19 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  24.27 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  21.95 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  24.51 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  20.95 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  25.78 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.91 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2697  putative branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.86 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.29 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  36.84 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  22.89 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2907  putative branched-chain amino acid transport system  28.14 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.43 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  21.58 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4563  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  25.68 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.62 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7508  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  36.36 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  21.67 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  33.63 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3455  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.235747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2700  hypothetical protein  21.8 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3860  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.35 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  21.26 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 382 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  22.25 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.32 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.52 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5014  putative branched-chain amino acid transport system  30.77 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  22.07 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  23.64 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.39 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.7 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  22.44 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3347  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  32.54 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.862215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.9 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3876  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  21.04 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  21.89 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0380  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  26.72 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3202  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  22.55 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.836908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6073  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  21.35 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  23.26 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0114  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  25.66 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  21.89 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>