57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5014 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5014  putative branched-chain amino acid transport system  100 
 
 		 435 aa  869    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2907  putative branched-chain amino acid transport system  55.94 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2697  putative branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  53.08 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4563  putative lipoprotein  33.61 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3860  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.65 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5015  hypothetical protein  55.42 
 
 		 84 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0380  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  23.05 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.51 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4487  putative high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.24 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3202  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  25.89 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.836908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  30 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  27.46 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4782  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  28.67 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  22.88 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  23.06 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2663  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  25.36 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  34.12 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  35.11 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.75 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  34.18 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  23.49 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  42.55 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1285  hypothetical protein  32.2 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.71 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  31.65 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  23.69 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3020  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  24.27 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  36.71 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  33.75 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  25.35 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  40.43 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2537  hypothetical protein  22.73 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00283871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  42.55 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.32 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3322  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  24.88 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.17 
 
 		 376 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>