48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4563 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4563  putative lipoprotein  100 
 
 		 424 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3860  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.9 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2907  putative branched-chain amino acid transport system  33.5 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2697  putative branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.09 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5014  putative branched-chain amino acid transport system  33.68 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4487  putative high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.33 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0380  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.69 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.29 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1285  hypothetical protein  37.29 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3455  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.235747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  23.65 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.33 
 
 		 378 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  36.79 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  33.96 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.91 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  35.58 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  33.03 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  33.96 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  30.58 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.17 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.2 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  26.4 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  27.45 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  23.17 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>