45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0380 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0380  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  100 
 
 		 442 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4487  putative high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.94 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4563  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3860  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.78 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2697  putative branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.41 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2907  putative branched-chain amino acid transport system  23.44 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5014  putative branched-chain amino acid transport system  21.64 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.72 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 372 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.45 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.15 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.01 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.98 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  22.82 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  26.5 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.25 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.91 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  43.08 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  22.48 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  22.48 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  19.76 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.29 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  26.62 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  24.41 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1285  hypothetical protein  30.83 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  35.78 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>