26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4487 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4487  putative high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  100 
 
 		 421 aa  855    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0380  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  33.78 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4563  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3860  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.62 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.53 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2697  putative branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.39 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2907  putative branched-chain amino acid transport system  26.77 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5014  putative branched-chain amino acid transport system  21.95 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3455  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.235747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1285  hypothetical protein  28.08 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.64 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  28.05 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2636  Extracellular ligand-binding receptor  33.87 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  27.27 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  24.55 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  22.51 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  24.16 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>