184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2700 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2700  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2955  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  59.09 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0324512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  57.11 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3169  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  57.67 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  53.06 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  53.75 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6824  hypothetical protein  54.48 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.759789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3271  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  55.82 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0519  hypothetical protein  55.12 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3119  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  53.06 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  52.55 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  54.35 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0462  hypothetical protein  55.53 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6234  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  50.53 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  38.85 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3675  hypothetical protein  37.68 
 
 		 408 aa  275  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  36.91 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  38.89 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5580  hypothetical protein  37.28 
 
 		 454 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  35.79 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7028  hypothetical protein  35.31 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3002  hypothetical protein  33.84 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2046  hypothetical protein  36.93 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.621675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2025  hypothetical protein  36.34 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0203629  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  34.1 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6809  hypothetical protein  59.81 
 
 		 180 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3895  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  35.59 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926603  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4368  hypothetical protein  42.16 
 
 		 117 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1979  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.18 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  24.87 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4735  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.34 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.96581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  25.15 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  24.56 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  23.18 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3347  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  24.36 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.862215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3676  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.99 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  25.47 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  31.22 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  25.34 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  23.36 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  32.45 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.19 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  22.37 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  23.17 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  24.6 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  22.87 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.43 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  37.04 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  24.92 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0595  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  40.91 
 
 		 82 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3633  Extracellular ligand-binding receptor  36.97 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.54 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  24.73 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3219  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.61 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  42.5 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  22.47 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0801  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  33.9 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.0350726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  23.53 
 
 		 497 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  25.5 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  21.13 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  23.94 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3225  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.01 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  22.66 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>