141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3225 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3225  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 416 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3219  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  77.4 
 
 		 410 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  74.32 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  27.05 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2046  hypothetical protein  28.75 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.621675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  28.81 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.81 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5580  hypothetical protein  28.88 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2025  hypothetical protein  26.81 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0203629  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3002  hypothetical protein  24.94 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7028  hypothetical protein  25.23 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  26.62 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.59 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  25.68 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  27.93 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  25.37 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  24.77 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3675  hypothetical protein  25.88 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6824  hypothetical protein  25.15 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.759789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0462  hypothetical protein  26.96 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3169  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26.53 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3271  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26.22 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3119  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.33 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2955  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  23.71 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0324512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  26.77 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0519  hypothetical protein  24.62 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  23.73 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  23.94 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3676  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.15 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4018  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  23.95 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1979  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.92 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  25.17 
 
 		 516 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6234  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  27.27 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  31.97 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  31.97 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  24.44 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  28.67 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  28.28 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  25.21 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.53 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  29.51 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  29.51 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  27.41 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2700  hypothetical protein  25.14 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.69 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  35.54 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  28.8 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3490  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.93 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8308  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.2 
 
 		 561 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  22.9 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  33.93 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  37.61 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  22.94 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1285  hypothetical protein  28.65 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  28.08 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  28.08 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>